1. 目的基因的获取
“切”
• 目的基因:准备要分离、改造、扩增或表达的基因。
• 目的/动机:
从现实生活中(的问题) 来
淀粉合成酶基因转入小麦:干扰、抑制某些合成途径,调整麦粒的淀粉合成途径(的比例),改变淀粉的组成、结构,改善面粉的品质。
b-胡萝卜素基因转入水稻:使稻谷籽粒也能合成b-胡萝卜素,提高稻米的(营养)价值。
• 目的基因的获取方法 /技术
PCR扩增 –已知基因,且了解(部分)序列特征
基因文库 –已有文库,且知道相关基因的特性
人工合成 –已知基因序列,且较短
PCR技术是核心
PCR [Polymerase Chain Reaction]的条件
模板DNA、引物对、反应缓冲液、反应底物、耐高温的DNA聚合酶等。
引物合成:根据欲扩增的DNA片段的3’-和5’-端的碱基序列特征来设计。一般18-23 bp,Tm=58-65 oC。
PCR的原理
高温变性 (95 oC)è 低温退火 (引物能够稳固结合上去,但原有模板DNA双链不能复性)è 适温延伸 (72 oC,指数扩增:PCR产物DNA的量约为2n)。PCR产物(DNA片段)长度一般200-1000 bp,多数约500 bp。
PCR的程序
(示例)
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1 |
95 oC |
15 min |
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35 |
94 oC |
30 s |
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60 oC |
45 s |
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72 oC |
1 min |
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1 |
72 oC |
10 min |
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25 oC |
1 min |
KEY POINT: PCR扩增得到的外源基因(DNA片段)和质粒载体用相同的内切酶加工成切口一致的片段。
•
限制性核酸内切酶(工具酶之一)
可把基因组DNA切成不同大小的片断
——基因组DNA片断化
识别特异的碱基序列,将DNA长链切割成为“接口”相互吻合的短片段
——适于连接(外来)DNA片段
酶切位点:回文序列和镜像重复序列
•
连接酶
2. 构建表达载体 /质粒
“连”
考虑:
外源 /目的基因有何特点和要求?
使外源基因表达或抑制基因的表达
将构建符合要求的DNA片段(insert DNA),连接到相应的空载体(Vector)中去。需要连接酶和相应的反应缓冲液、ATP、DTT和适当的温度等条件。
3. 目的基因导入受体细胞
“转”
•
相关概念
遗传转化:通过某种途径(或技术)将外源基因导入受体细胞的基因组中,并使之在受体细胞中表达。
•
外源基因导入受体细胞的方法有多种,根据是否采用基因载体为介导,可归纳为两类:
农杆菌介导的遗传转化
基因(DNA)的直接导入
导入植物细胞的方法,如:化学共培养法(PEG)(Lorz等,1985);子房注射法(Dela Pena等,1987);种胚吸收DNA法(Topfer等,1989);花粉管通道法(Luo and Wu,1988);碳化硅纤维法(Kaeppler等,1990);组织电击法(D’Halluin,1992)和基因枪法(Sanford等,1988)。
+导入动物细胞、微生物细胞
• 基因枪法基本原理:
结合有DNA的金属微粒被称之为微载体或微弹,携带载有微弹的尼龙或塑料弹头被称之为载体或微弹载体。
基因枪利用火药爆炸、高压放电引起水滴气化或高度压缩的(氦气、氮气或其它)气体的爆炸性释放产生的动力。驱动载有微弹的微弹载体高速运动(328-656 m/s)。当微弹载体抵达弹膛时被带有穿孔的挡板所拦截,而微弹由于惯性作用继续高速运动并击中靶细胞。
根据其动力的不同,可分为
火药式基因枪 PDS-1000系统(杜邦公司,1990)
JQ-700型基因枪(中科院生物物理所)
如:洋葱、烟草、水稻、玉米和小麦
放电式基因枪
如:大豆
气动式基因枪 PDS-1000/He
(Bio-Rad公司) 如:玉米
农杆菌介导的遗传转化
•
单子叶植物的遗传转化受农杆菌寄主的限制
解决方案?–e.g. 加辅助菌
将已构建好的细菌质粒大片段(含目的基因及相应的启动子、终止子、标记基因等)转入经改造的农杆菌质粒中,再经(三亲本)共培养【triparental mating,三亲本交配】,将外源基因转到受体细胞中去。
组织培养与植株再生
将转入了含有目的基因的细胞/愈伤组织在适当的培养基和选择压力下进行组织培养,经成芽诱导、生根诱导等,获得再生植株。
4. 目的基因的检测与鉴定
“选”
实际上,每个步骤都包含此内容:
检测,筛选到含有目的基因的菌株,进行后续操作。
如,
“切”:电泳PCR产物,看片段大小所否吻合。
“接”:再酶切,大小与设计的一致。再测序,确保所有序列正确。
“转”:检测目的基因在受体细胞内是否稳定存在和“正常”